来自相关矩阵的网络

时间:2013-03-25 11:45:19

标签: r

我想从相关矩阵构建一个网络,因此使用R中的mixOmics包尝试了以下内容:

 bairavaa<-network(th, comp = 1:3, color.edge = c("blue", "red"), interactive = FALSE, threshold = 0.80)

以上还包括-0.80和-1之间的值,我想忽略它。

如果我使用:

  bairavaa<-network(th, comp = 1:3, color.edge = c("white", "red"), interactive = FALSE, threshold = 0.80)

虽然没有显示边缘,但是存在负面节点,因此无法使用该对象进行社区检测。

是否有任何其他程序包可以绘制具有高于某个阈值的正相关值的网络,或者以某种方式继续在包含负值的网络中进行社区检测。

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