我正在使用trnL叶绿体基因从食草动物粪中鉴定植物，目前我正试图将分类学分配给我的Illumina输出中的trnL序列。以下是我想要运行的QIIME脚本和选项：
assign_taxonomy.py -i rep_set_numbered.fa -r sequence.fasta -t id_to_taxonomy.txt -e 0.01 -m blast
我有来自数据管道的输入文件，以及来自NCBI GenBank的参考文件（205,703个序列）。但是，我没有制表符分隔的分类法文本文件。通常我会从Excel生成一个，但由于FASTA文件太大（超过500 MB），因此无法在Excel中完全查看，因此无法可靠地编辑。
我的问题是，是否有一个命令行方法用于从我的参考FASTA文件生成我自己的制表符分隔的分类文件，如果有，我该怎么做？如果没有，在＆＃34; assign_taxonomy.py＆＃34;处理这个必需选项的其他选择是什么？ QIIME脚本？