覆盖不同的物种积累地块

Question

我想在R中绘制一些物种积累曲线，它们可以以灰度格式叠加在彼此之上，同时易于解释。 Here是我想要输出的绘图类型的链接，多边形拥有不同类型的灰色和透明度，行具有不同的lty值。一些示例数据：

df1 <- as.data.frame(matrix(sample(0:1, 3*10, replace=TRUE), ncol=3))
df2 <- as.data.frame(matrix(sample(0:2, 4*10, replace=TRUE), ncol=4))
library(vegan)
spec1 <- specaccum(df1)
spec2 <- specaccum(df2)

到目前为止，我已经使用了plot（不是很好的示例数据，但基本原则也适用）：

plot(spec2, ci.type = "polygon", ci.lty = 0, ci.col = "grey")
plot(spec1, ci.type = "polygon", ci.lty = 0, ci.col = "gray50",add= TRUE)

当我尝试更改lty时，它会说：

  

多边形错误（c（xaxvar，rev（xaxvar）），c（x $ richness - ci * x $ sd，rev（x $ richness +：     正式参数“lty”由多个实际参数匹配。

我不知道如何克服这个问题。任何帮助将不胜感激。

Answer 1

根据您的数据，您需要将ci.col参数更改为rgb()颜色规范，其alpha值为透明度（see here for details， - 请注意，根据文档，所有设备可能都不支持透明度：

plot(spec2, ci.type = "polygon", ci.lty = 0, ci.col = rgb(0, 0, 0, 0.5))
plot(spec1, ci.type = "polygon", ci.lty = 1, ci.col = rgb(.5, .5, .5, 0.5),add= TRUE).

这将给你以下情节：