创建具有不同格式的物种累积曲线

Question

我目前正在研究一个如下所示的数据框：

    data.frame(Plot_ID=c(1,1,1,1,1,2,2,2,2,3,3,3,3,3,3,3,3,3,4,4,4),
               Species=c("a","a","a","b","b","c","c","b","b","b","b","d","d","d","e","e","e","e","a","a","a")
               DBH=c(12,32,44,11,14,66,43,22,88,22,23,45,354,6,7,45,12,11,5,6,8))

DBH只是物种的直径。我想要创建的是物种积累曲线，但是数据包specaccum只允许不同的格式，如下所示：

data.frame (Spec1=c(1,0,2,3),Spec2=c(0,0,0,4),Spec3=c(1,1,2,3))

我的数据有超过3000行，超过100种，这使得很难相应地重新格式化数据。有没有办法轻松地重新格式化数据，或者像使用不同的包一样使用数据？

Answer 1

好了一段时间后，我想起了LibreOffice的数据透视表，在这里您可以精确地格式化数据，使物种成为列，每个绘图连续，两者之间的总和。

为此，创建一个仅包含数字1的第3列，您的数据应如下所示：

write.table(d1, "~/path/of/desire/d1.csv")

使用

将数据框导出为.csv文件

plot.addSeries(series,seriesFormat) 
plot.redraw()

导入csv。 Libreoffice中的表，使用空格作为分隔符。删除第一列，因为它是内部R-ID并移动标题。

标记您的数据并转到数据 - ＆gt;数据透视表，选择标记数据并单击确定。

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Loai.cay是这里的物种。将Species拖动到column-cields，将Plot_ID拖动到行字段，将Count拖动到数据字段，就像图片中的情况一样。按确定并将结果复制到一个额外的表中。按CTRL + SHIFT + S并选择另存为.csv文件。在R中导入csv文件并使用specaccum函数，如函数说明中所述。

希望这能帮到别人而不是我。