Question

我试图在JAVA中使用ELKI来运行DBSCAN。为了测试，我使用了FileBasedDatabaseConnection。现在我想用自定义对象作为参数运行DBSCAN。

我的对象具有以下结构：

public class MyObject {
  private Long id;
  private Float param1;
  private Float param2;
  // ... and more parameters as well as getters and setters
}

我想使用List<MyObject>作为数据库在ELKI中运行DBSCAN，但是只应考虑一些参数（例如，使用参数param1，param2和param4在对象上运行DBSCAN ）。理想情况下，生成的集群包含整个对象。

有没有办法实现这种行为？

如果没有，我如何将对象转换为ELKI理解的格式，并允许我将生成的集群对象与我的自定义对象匹配（即，是否有一种以编程方式设置标签的简单方法）？

以下问题涉及featureVectors：Using ELKI on custom objects and making sense of results
这可能是我的问题的可能解决方案吗？如何从我的List<MyObject>创建一个特征向量？

Answer 1

ELKI采用模块化架构。

如果您需要自己的数据源，请查看datasource包，并实现DatabaseConnection（JavaDoc）接口。

如果您想处理MyObject个对象（您上面分享的课程可能会对性能造成重大影响），那并不是特别难。您需要SimpleTypeInformation<MyObject>（JavaDoc）来标识您的数据类型，为您的数据类型实现PrimitiveDistanceFunction （JavaDoc）。

如果您的实际数据是花车，我建议您改用DoubleVector或FloatVector，并使用例如SubspaceEuclideanDistanceFunction仅处理您要使用的属性。

对于这些数据类型和许多距离函数，可以使用R * -tree索引大大加快DBSCAN执行时间。

ELKI中的Cluster（JavaDoc）从不存储点数据。它只存储点DBIDs（Wiki）。您可以从数据库关系中获取点数据，或者使用例如offsets（Wiki）将它们映射回静态数据库的列表位置。

ELKI：在Java中使用自定义对象运行DBSCAN

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