Question

我正在进行DBSCAN聚类，除了纬度经度之外我还有一个列，我希望看到聚类结果。例如，数据如下所示：

28.6029445  77.3443552  1
28.6029511  77.3443573  2
28.6029436  77.3443458  3
28.6029011  77.3443032  4
28.6028967  77.3443042  5
28.6029087  77.3442829  6
28.6029132  77.3442797  7

现在在minigui如果我将parser.labelindices设置为2并运行任务，那么输出如下所示：

# Cluster: Cluster 0
ID=63222 28.6031295 77.3407848 441
ID=63225 28.603134 77.3407744 444
ID=63220 28.6031566667 77.3407816667 439
ID=63226 28.6030819 77.3407605 445
ID=63221 28.6032 77.3407616667 440
ID=63228 28.603085 77.34071 447
ID=63215 28.60318 77.3408583333 434
ID=63229 28.6030751 77.3407096 448

所以它仍然连接到我作为label传递的第3列。我通过传递纬度和经度以及它完全相同来检查聚类结果。所以在某种程度上通过将列作为＆＃39;标签＆＃39;我可以在群集结果中使用lat long检索该列。

现在我想在我的java代码中使用它

// Setup parameters:
            ListParameterization params = new ListParameterization();
            params.addParameter(
                    FileBasedDatabaseConnection.Parameterizer.INPUT_ID,
                    fileLocation);
            params.addParameter(
             NumberVectorLabelParser.Parameterizer.LABEL_INDICES_ID,
             2);
            params.addParameter(AbstractDatabase.Parameterizer.INDEX_ID,
                    RStarTreeFactory.class);

但这是NullPointerException。 MiniGui dbc.parser默认为NumberVectorLabelParser。所以这应该工作正常。我错过了什么？

Answer 1

我将查看NPE，它应该返回更有用的错误消息。

最有可能的问题是，此参数的类型为List<Integer>，即您需要传递列表。或者，您可以传递将被解析的String。以下应该可以正常工作：

params.addParameter(
         NumberVectorLabelParser.Parameterizer.LABEL_INDICES_ID,
         "2");

请注意，文本编写器可能（我没有检查过）打印标签。因此，您无法将输出视为您认为数据集为3维的指示。

调试处理程序-resulthandler LogResultStructureResultHandler -verbose应该为您提供类型输出：

java -jar elki.jar KDDCLIApplication -dbc.in dbpedia.gz \
-algorithm NullAlgorithm \
-resulthandler LogResultStructureResultHandler -verbose

应该产生这样的输出：

de.lmu.ifi.dbs.elki.datasource.FileBasedDatabaseConnection.load: 1941 ms
de.lmu.ifi.dbs.elki.algorithm.NullAlgorithm.runtime: 0 ms
BasicResult: Algorithm Step (main)
 StaticArrayDatabase: Database (database)
  DBIDView: Database IDs (DBID)
  MaterializedRelation: DoubleVector,dim=2 (relation)
  MaterializedRelation: LabelList (relation)
 SettingsResult: Settings (settings)

在这种情况下，我的数据集是来自维基百科的坐标，每个都有一个名称。我有一个2维DoubleVector关系，以及一个存储对象名称的LabelList关系。

ELKI DBSCAN：如何设置dbc.parser？

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