如何使用具有预计算距离矩阵的ELKI用于DBSCAN

Question

我为数据库中的所有点预先计算了距离矩阵。 我正试图用以下命令调用ELKI gui：

            /usr/share/java/elki.jar 
            -dbc.in xml_files.1000 
            -dbc.filter FixedDBIDsFilter 
            -dbc.startid 0 
            -algorithm clustering.DBSCAN 
            -algorithm.distancefunction external.FileBasedDoubleDistanceFunction 
            -distance.matrix Distance.txt 
            -dbscan.epsilon 1 
            -dbscan.minpts 10

但我一直收到以下错误消息：

参数格式错误！参数“dbscan.epsilon”需要距离值，但未设置距离！

我无法弄清楚我在这里做错了什么......

Answer 1

您使用的是哪个版本的ELKI？

此错误消息通常表示矩阵读取器使用的距离解析器存在问题。

由于ELKI支持不同的值距离函数，因此DBSCAN无法解析epsilon参数，直到知道实际距离值类型（这将提供值解析函数）。

以前的错误消息是什么？如果您有任何先前的错误（包括缺少必需的参数），它将阻止DBSCAN能够解析该值。

尝试设置epsilon值 last ，并尝试命令行。在MiniGUI中，由于参数设置的增量方式，不幸的是这些动态类型的参数可能是不稳定的。任何改善这些参数处理的补丁都值得赞赏。