计算表面并存储为Excel文件

时间:2015-05-15 12:09:33

标签: imagej imagej-macro

我是imageJ的新手,我正在尝试分析几张图片: 我有一个代码可以分析目录中一组图像的颜色阈值并单独存储它们:

input = "/m_3/ImageJ/test_folder/";
output = "/m_3/ImageJ/finished2/";

function action(input, output, filename) {
    open(input + filename);
run("Set Scale...", "distance=872 known=9 pixel=1 unit=cm");
run("Color Threshold...");
// Color Thresholder 1.48v
// Autogenerated macro, single images only!
.
.
.
// Colour Thresholding-------------

saveAs("Jpeg", output + filename);
        close();
    }

setBatchMode(true); 
list = getFileList(input);
for (i = 0; i < list.length; i++)
        action(input, output, list[i]);
setBatchMode(false);

现在我想计算新保存图像的面积,这应该与函数测量一起使用..

run("Measure");

如何将计算存储在.xls或.csv -files中? 是否也可以计算一个目录中所有文件的面积,并将结果存储在一个.xls或.csv -file中?

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

查看斐济维基上的解释how to apply a common operation to a complete directory。您可以打开每个新保存的图像,设置阈值,测量并关闭每个图像,如下所示:

DATEDIFF()

并将该代码粘贴到脚本编辑器的处理文件夹模板(模板&gt; IJ1宏&gt;处理文件夹)中。

之后,结果表可以通过文件&gt;保存为 .xls 文件。另存为... 或:

open("/path/to/your/image.jpg");
setAutoThreshold("Default");
run("Measure");
close();