是否可以生成考虑颜色和透明度的热图，这两个参数由两个不同的矩阵给出（矩阵1定义颜色，矩阵2定义alpha）？
关于我所追求的更多信息：
我已经在gplots包中成功使用了R和heatmap.2函数来生成热图 - 在这种情况下可视化miRNA相互作用。在这里，我想要展示的是沿着miRNA的典型20-24个核苷酸的特定核苷酸参与靶配对的概率。我的热图矩阵由miRNA（行）和位置1-24（列）组成，每个单元格中具有数字削减概率。一个例子是改变由矩阵值确定的颜色的alpha参数，例如white = no配对，暗红色=高配对。
热图.2函数适用于单个此类图，但我现在想从两个不同的物种中获取重叠信息。因此，我需要我的热图基本上考虑两个矩阵：
1）具有物种重叠程度的矩阵，例如范围从红色 - 紫色 - 蓝色到物种1 - 仅到物种1 + 2到物种2 - 。
2）具有平均配对程度的矩阵，例如，通过alpha参数可视化，该参数来自矩阵1中给定位置的弱到强的平均配对（无论颜色）。
我试图使用这篇文章中的原则：
Place 1 heatmap on another with transparency in R
但未能将其建议应用于我自己的问题。
提前致谢！