如何在ComplexHeatmap包中创建颜色边框

时间:2017-01-17 00:21:04

标签: r heatmap

在ComplexHeatmap包中,我无法找到一种在热图周围绘制边框的方法。我在附图中说明了这个问题。有人可以帮我这么做吗?提前谢谢!

示例代码:

library(ComplexHeatmap)
library(circlize)

set.seed(123)
mat = matrix(rnorm(80, 2), 8, 10)
mat = rbind(mat, matrix(rnorm(40, -2), 4, 10))
rownames(mat) = paste0("R", 1:12)
colnames(mat) = paste0("C", 1:10)
#plot
Heatmap(mat, cluster_rows = F, cluster_columns = F, show_heatmap_legend = FALSE)

带边框的示例图片。 enter image description here

1 个答案:

答案 0 :(得分:4)

我收到了作者的电子邮件回复。

mat = matrix(rnorm(100), 10)

Heatmap(mat, name  = "foo")

decorate_heatmap_body("foo", {

    grid.rect(gp = gpar(fill = "transparent", col = "black", lwd = 2))

})

decorate_heatmap_body()中,第一个参数是" name"热图

,您需要在Heatmap()中定义。