Question

我有一个21x5大小的矩阵（top5features），包含从21个癌症结节中提取的5种不同特征类型的值。我正在尝试对我的数据应用主成分分析并绘制结果，但我很难理解如何这样做。以下是我的代码到目前为止，但它只绘制了一部分数据，我不相信它是我想要的：

top5features = features(1:21,[42 55 61 62 60]);
[W, pc] = princomp(top5features);
pc = pc'; W = W';
plot(pc(1,:),pc(2,:),'.');
title('{\bf PCA} of Top 5 Features')

我的目标是制作情节，使其有21个点，每个点与特定的结节有关。这21个结节也分为两组，如果可能的话，我想根据它们所属的组对它们进行颜色编码。我有点像使用Matlab的初学者，任何帮助都会受到赞赏。

Answer 1

鉴于您的评论，PCA分解数据的前10列表示一组，而PCA分解数据的最后11列表示另一组。这可以简单地在一个plot命令中完成，使用您之前的代码：

%// Your code
top5features = features(1:21,[42 55 61 62 60]);    
[W, pc] = princomp(top5features);    
pc = pc'; W = W';

%// Group 1
group1 = pc(:,1:10);
%// Group 2
group2 = pc(:,11:21);

%// Plot as separate colours
plot(group1(1,:), group1(2,:), 'b.', group2(1,:), group2(2,:), 'r.');    
title('{\bf PCA} of Top 5 Features')
legend('Group 1', 'Group 2');

上面的代码首先将您的PCA缩减数据分成您指定的两个组。接下来，我们使用单个plot命令在一个图上将两个组一起绘制，但我们对它们进行颜色区分。蓝色表示组1，红色表示组2.我们在每个点上放置点标记。作为奖励，我们添加一个图例，表示每个点属于哪个组。

希望这有帮助！

Matlab - 绘制PCA分析

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