R中的线性相关分析

时间:2014-11-29 00:10:27

标签: r correlation linear

我有一个关于在R中执行线性相关分析的问题。基本上我有两个表:一个列名称为单元格类型(30个单元格类型),然后是23000个基因的行名称及其每个单元格的表达值类型,第二个表与第一个表具有完全相同的列名,除了行名称为200 lncRNA及其每个单元格类型的表达式值。

我想做的是运行循环(或者如果有更简单的方法!),以便计算基因和lncRNA表达数据的每个组合(即23000个基因×200个lncRNA)的Pearson系数。我真的不知道从哪里开始这个或代码应该是什么样子。任何帮助将不胜感激!

1 个答案:

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要获得所有行组合之间的相关性,请尝试

cor(t(df1), t(df2))