Question

我希望能够在多个节点上安排作业，每个节点有一个进程。我还希望该进程使用使用该节点上可用的所有核心的线程。我知道＆＃34; ppn＆＃34;用于安排PBS作业，所以我尝试使用Univa调度程序。冒号分隔符不起作用，所以我使用了两个＆＃39; -l＆＃39;标志。我试过

qsub -cwd -j y -l nodes=4 -l ppn=1 -N hellonodes mpirunscript.sh

这给出了

无法运行工作：未知资源＆＃34; ppn＆＃34;。

退出。

在qsub的手册页中说明了

complex（5）描述了可用资源及其列表可以获得相关的有效值说明符。

遗憾的是，我正在使用的群集上不存在此类文档。但是，我发现了一个here。最后我发现要获取可设置资源值列表，我需要运行

qconf - sc

此输出如下（缩写）：

#name               shortcut   type        relop   requestable consumable default  urgency 
#------------------------------------------------------------------------------------------
...
cpu                 cpu        DOUBLE      >=      YES         NO         0        0
...
m_numa_nodes        nodes      INT         <=      YES         NO         0        0
m_socket            socket     INT         <=      YES         NO         0        0
m_thread            thread     INT         <=      YES         NO         0        0
...
num_proc            p          INT         ==      YES         NO         0        0
...
slots               s          INT         <=      YES         YES        1        1000
...

＆＃34; PPN＆＃34; （没有列出PBS的每个节点的进程），也没有找到类似的东西。任何人都可以告诉我这是否可能，如果是的话，怎么样？

Answer 1

由于它是一个并行作业，您需要使用-pe请求并行环境管理员必须创建一个首先满足您要求的并行环境。然后它是持久的，可以用于这种类型的并行作业。请参阅：http://www.gridengine.eu/mangridengine/htmlman5/sge_pe.html

创建并行环境：qconf -ap mype 列出所有PE：qconf -spl 然后将PE附加到您的队列：qconf -mq all.q（如果是all.q） - ＆GT; “pe_list mype”

重要的是：allocation_rule 在这里你需要设置：1 - ＆gt;这意味着每个计算主机有一个进程。

将插槽设置为较高的值（例如群集中的核心数量）。这是使用此并行环境的所有作业的限制。

然后您或您的用户可以开始您的工作：qsub -pe mytpe 8 myscript.sh

然后，您将获得此作业的8个计算节点，每个节点有1个插槽。 qstat -g t显示你在哪里。

这有帮助吗？

丹尼尔

如何使用qsub Univa 8.1.7在多个节点上安排作业？

1 个答案: