我找到了获得hsp身份的方法，但是没有对齐。一个对齐可以有多个hsp，这意味着hsp的得分（身份）不等于对齐。 当我在网页上爆炸时，我总是得到对齐的分数和身份。 这是我提出的任何逻辑问题，谁可以解释这个？
答案 0 :(得分：0)
网页为您提供了某些HSP的身份，而不是完整的对齐方式。例如。这两个HSP：
1203 bits(651) 0.0 730/769(95%) 1/769(0%) Plus/Minus
106 bits(57) 6e-19 70/76(92%) 2/76(2%) Plus/Minus
计算：
Max Total Cover eVal ident
1203 1309 100% 0.0 95%
因此网络只是添加得分（1203 + 106 = 1309）并且可能平均eval和ident（730 + 30）/（769 + 76）= 0.9467~0.95。所以这就是你模仿网络BLAST“加入”统计数据的方式。根据记录，这两个HSP之间存在差距，web-BLAST未包含在统计数据中。