我使用的是Windows 7.我安装了python 2.7和Biopython 1.57。我创建了以下脚本：
from Bio.Clustalw import MultipleAlignCL
cl = MultipleAlignCL("myseqs.fasta")
print("Command line: %s"%cl)
clpath="C:\Program Files\ClustalW2\clustalw2.exe"
cl = MultipleAlignCL("myseqs.fasta",command=clpath)
from Bio.Clustalw import do_alignment align = do_alignment(cl)
但是我收到了一条错误消息。
答案 0 :(得分：4)
这是一个措辞不好的问题 - 细节在哪里？
您是否能够手动在命令行安装和运行ClustalW？什么版本？您尝试过什么版本的Biopython？您使用的是哪种操作系统（可以产生很大的影响）？您收到了哪些错误消息？
您是否尝试过在Biopython教程中运行ClustalW的示例？ http://biopython.org/DIST/docs/tutorial/Tutorial.html或http://biopython.org/DIST/docs/tutorial/Tutorial.pdf