biojava中的atomchace功能

时间:2014-08-20 08:19:19

标签: java netbeans biojava

大家好,我对biojava很新,并试图实现这段代码:

AtomCache cache = new AtomCache();
cache.setPath("/tmp/");
FileParsingParameters params = cache.getFileParsingParams();
params.setLoadChemCompInfo(true);
StructureIO.setAtomCache(cache);
Structure strucuture = StructureIO.getStructure("4HHB");

执行这些行后,我收到以下错误信息:

  

线程中的异常" main" java.lang.NoSuchFieldError:lineSplit     在org.biojava.bio.structure.align.util.UserConfiguration。(UserConfiguration.java:87)     在org.biojava.bio.structure.align.util.AtomCache。(AtomCache.java:115)     在protein_structure.main(protein_structure.java:27)   Java结果:1

我无法弄清楚这个错误的原因,我下载了pdb文件中我正在使用的蛋白质(在这种情况下" 4HHB"在/ tmp /目录中但仍显示相同的错误谁能告诉我Atomcache功能是如何工作的?谢谢

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