Question

我正在尝试使用此处的示例： http://www.biojava.org/wiki/BioJava%3aCookbook%3aSeqIO%3aReadGESBiojavax

然而，它无法找到我使用的org.biojava导入。我尝试下载并编辑POM.xml并将其添加到项目中，但它没有任何效果。有什么建议吗？

Answer 1

您正在查看的示例是遗留biojava版本1.8.X的一部分。尝试查看3.X系列中的示例...... http://www.biojava.org/wiki/BioJava:CookBook

Answer 2

你在使用Maven吗？如果是这种情况，您应该熟悉将其包含在自己的 pom.xml（不是下载的）中：

<dependencies>
  ...
  <dependency>
    <groupId>org.biojava</groupId>
    <artifactId>biojava3-core</artifactId>
    <version>3.0.3</version>
    </dependency>
    <!-- other biojava jars as needed -->
</dependencies>
<repositories>
  <repository>
    <id>biojava-maven-repo</id>
    <name>BioJava repository</name>
    <url>http://www.biojava.org/download/maven/</url>           
  </repository>
</repositories>

如果您不使用Maven（我和biojava都不推荐），您可以在此处下载所需的jar文件：http://www.biojava.org/download/maven/org/biojava/ 但要注意：您必须自己下载并添加biojava使用的所有传递依赖项（.jar文件）。我强烈建议您在这种情况下尝试Maven！

Answer 3

您需要下载biojava.jar并将其包含在您的类路径中（您可以从here手动下载） - 请注意.jar文件可能还需要一些其他必需的.jars

如果您有一个pom.xml，您可以将项目设置为maven兼容然后运行maven - 它将下载所有必需的.jars并正确设置类路径（如果pom文件配置正确）

biojava import org.biojava无效

3 个答案: