标签: k-means hierarchical-clustering dna-sequence
我需要执行K-means聚类和我以FASTA格式下载的DNA序列(核苷酸)序列的分层聚类。因此,在执行聚类之前,我需要对基数(a,t,c,g)进行DECIMAL ENCODING ..所以如何做到这一点...以便我可以在MATLAB中以矩阵形式获取此输入?
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使用nt2int功能。下面的文档:
http://www.mathworks.com/help/bioinfo/ref/nt2int.html