假设我有一个双变量离散分布,即概率值P(X = i,Y = j)表,i = 1,... n和j = 1,... m。如何从这样的分布中生成随机样本(X_k,Y_k),k = 1,... N?也许有一个现成的R函数,如:
sample(100,prob=biprob)
哪里的biprob是二维矩阵?
一种直观的采样方式如下。假设我们有一个data.frame
dt=data.frame(X=x,Y=y,P=pij)
x和y来自
expand.grid(x=1:n,y=1:m)
和pij是P(X = i,Y = j)。
然后我们得到大小为N的样本(Xs,Ys),方法如下:
set.seed(1000)
Xs <- sample(dt$X,size=N,prob=dt$P)
set.seed(1000)
Ys <- sample(dt$Y,size=N,prob=dt$P)
我使用set.seed()来模拟“双变量”。直观地说,我应该得到类似于我需要的东西。我不确定这是否正确。因此问题:)
另一种方法是使用吉布斯采样,边缘分布很容易计算。
我尝试使用谷歌搜索,但没有真正相关的内容。
答案 0 :(得分:8)
你快到了。假设您的数据框dt
包含x,y和pij值,只需对行进行采样!
dt <- expand.grid(X=1:3, Y=1:2)
dt$p <- runif(6)
dt$p <- dt$p / sum(dt$p) # get fake probabilities
idx <- sample(1:nrow(dt), size=8, replace=TRUE, prob=dt$p)
sampled.x <- dt$X[idx]
sampled.y <- dt$Y[idx]
答案 1 :(得分:7)
我不清楚为什么你应该关心它是双变量的。概率总和为1,结果是离散的,因此您只是从categorical distribution进行采样。唯一的区别是您使用行和列而不是单个位置索引观察。这只是表示法。
在R中,您可以通过重新整形数据和从分类分布中抽样,轻松地从您的分布中进行抽样。可以使用rmultinom
并使用which
来选择索引,或者像Aniko建议的那样,使用sample
对重新整形数据的行进行采样,从而对分类进行抽样。一些簿记可以照顾你的确切案例。
这是一个解决方案:
library(reshape)
# Reshape data to long format.
data <- matrix(data = c(.25,.5,.1,.4), nrow=2, ncol=2)
pmatrix <- melt(data)
# Sample categorical n times.
rcat <- function(n, pmatrix) {
rows <- which(rmultinom(n,1,pmatrix$value)==1, arr.ind=TRUE)[,'row']
indices <- pmatrix[rows, c('X1','X2')]
colnames(indices) <- c('i','j')
rownames(indices) <- seq(1,nrow(indices))
return(indices)
}
rcat(3,pmatrix)
这将从您的矩阵中返回3个随机抽取,报告行和列的i
和j
:
i j
1 1 1
2 2 2
3 2 2