如何防止Matplotlib剪掉我的轴标签？

Question

我正在为一篇科学论文准备一些情节，为了符合页面限制，这篇论文需要广泛而简短。但是，当我将它们保存为pdf时，缺少x轴标签，因为（我认为）它们位于边界框之外。

将以下内容放入iPython笔记本中可以重现此问题。

%pylab inline
pylab.rcParams['figure.figsize'] = (8.0, 2.0)
plot([1,5,2,4,6,2,1])
xlabel("$x$")
ylabel("$y$")
savefig("test.pdf")

生成的pdf文件如下所示：

如何更改pdf文件的边界框？理想情况下，我想要一个“做得恰到好处”的解决方案，即自动调整大小，使一切都整齐，包括摆脱左右两侧不必要的空间 - 但我很匆忙，所以我会解决任何方式更改边界框，我会猜测数字，直到它看起来正确，如果我必须。

Answer 1

在谷歌搜索后，我找到了答案：您可以bbox_inches='tight'给savefig命令，它会自动将边界框调整为内容大小：

%pylab inline
pylab.rcParams['figure.figsize'] = (8.0, 2.0)
plot([1,5,2,4,6,2,1])
xlabel("$x$")
ylabel("$y$")
savefig("test.pdf",bbox_inches='tight')

我想这些是一些紧凑的英寸。

请注意，这与Ffisegydd的回答略有不同，因为它会将边界框调整到绘图，而不是更改绘图以适应边界框。 （但两者都适用于我的目的。）

Answer 2

您可以使用plt.tight_layout()让matplotlib调整绘图的布局。 tight_layout()会自动调整尺寸，也可以在（例如）重叠标签/刻度/等时使用。

%pylab inline

pylab.rcParams['figure.figsize'] = (8.0, 2.0)

plot([1,5,2,4,6,2,1])

xlabel("$x$")
ylabel("$y$")

tight_layout()

savefig("test.pdf")

这是输出的.png（无法将pdf上传到SO，但是我已经检查了它，它对pdf的工作方式相同）。

Answer 3

如果你正在准备科学论文的情节，我建议做剪辑＆＃39;独自一人 使用

plt.subplots_adjust(left,right,bottom,top,..)

创建图形之后和保存之前。如果您从ipython控制台运行，您也可以在生成数字后调用subplots_adjust，并通过反复试验来调整边距。一些后端（我认为至少Qt后端）也公开了这个功能的GUI。

手动执行此操作需要时间，但大多数时候都会提供更精确的结果，尤其是根据我的经验使用Latex渲染。

这是唯一的选项，只要您必须垂直或水平堆叠两个数字（例如subfigure之类的包），因为tight_layout不能保证两个数字中的相同边距，并且该轴将导致错位。

对于使用matplotlib进行发布，这是一个很好的link，例如，如何设置图形宽度以匹配日记列宽度。