是否可以进行全景多维堆栈"在ImageJ?

时间:2014-03-31 15:41:12

标签: imagej panoramas neuroscience

我正在做免疫组织化学,我有两种不同的信号,想要进行细胞计数。

我的想法是在二维中使用z-stack(20帧)(标记1,标记2)。这对我来说对于一张图片来说没有问题。然而,我正在看的区域很大,我想使用高放大倍率,所以我想将不同的图像组合成一个非常大的图像,这两个图像也是z堆叠的。

这可能吗,任何提示?

编辑:另外,需要注意的是,我没有配备电动载物台的共焦显微镜,只有普通的落射荧光显微镜没有摩擦阶段。

谢谢, 普拉兹

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

只要您的图像包含大量重叠(不需要电动载物台,只需确保两个相邻图像在其边界共享一些视觉特征),您就可以使用{{3}附带的Stitching插件。 }}:

  • 插件>拼接>网格/收藏拼接
  • 在第一个对话框中,选择类型:未知位置

如果您的不同z级别和颜色通道位于不同的文件中,您可能必须先将它们组合成hyperstacks(图像>颜色>合并通道... ),然后再拼接。