ImageJ - 批量堆叠的图像

Question

我有.tiff文件，每个文件包含25个堆栈部分。有没有办法批量使用“Image to Stack”命令？每个数据集包含所有三个颜色通道的60个tiff。

由于 恭

Answer 1

发现如何执行这些操作的一般方法是使用宏录制器，您可以在Plugins > Macros > Record ...下找到它。然后，如果您转到File > Import > Image Sequence...并正常选择序列的第一个文件，您应该会在录像机中看到如下内容：

run("Image Sequence...", "open=[/home/mark/a/1.tif] number=60 starting=1 increment=1 scale=100 file=[] or=[] sort");

为了让它适用于任意数量的切片（我的例子恰好有60个），只需省略number=60位。因此，例如，要将此文件目录从命令行转换为单个文件，您可以执行以下操作：

imagej -eval 'run("Image Sequence...", "open=[/home/mark/a/1.tif] starting=1 increment=1 scale=100 file=[] or=[] sort"); saveAs("Tiff", "/home/mark/stack.tif");' -batch