优化问题,非线性:自动分析Jacobian / Hessian来自物镜和R中的约束?

时间:2014-02-21 05:30:25

标签: r automatic-differentiation

在R中,当您仅提供优化问题的目标函数和约束时,是否可以分析地找到雅可比/ Hessian /稀疏模式?

AMPL做到这一点,从我听到的情况来看,即使是MATLAB也能做到这一点,但我不知道你是否需要Knitro。

然而,R的所有优化工具(例如nloptr)似乎都需要 me 来自己输入渐变和Hessian,这是非常困难的,因为我正在使用复杂模型。

4 个答案:

答案 0 :(得分:4)

您要找的是automatic differentiation。可悲的是,在我看来它在R中是不可用的。

attempts 5 years ago来实施它,但我的简短调查显示这些尝试已经消失。

有一个相当新的R包(Automatic Differentiation Model Builder),但我不清楚如何使用它,或如何将其应用于您的情况。 (我自己不使用R,这就是我不知道的原因。)

答案 1 :(得分:2)

1) optim中的默认Nelder Mead方法不需要派生词,也不会在内部计算它们。

2) Dderiv和相关的R函数(请参阅?deriv)可以计算简单的符号导数。

3) Ryacas package可以计算符号衍生物。

答案 2 :(得分:1)

查看solnp,包Rsolnp。它是一个非线性编程求解器,不需要分析Jacobian或Hessian:

min f(x)
s.t. g(x) = 0
l[h] <= h(x) <= u[h]
l[x] <= x <= u[x]

答案 3 :(得分:0)

我在R中为自动差异写了一个基本包,称为madness。虽然它主要是为多变量delta方法设计的,但它也可以用于自动计算梯度。示例用法:

require(madness)

# the 'fit' is the Frobenius norm of Y - L*R
# with a penalty for strongly negative R.
compute_fit <- function(R,L,Y) {
    Rmad <- madness(R)
    Err <- Y - L %*% Rmad
    penalty <- sum(exp(-0.1 * Rmad))
    fit <- norm(Err,'f') + penalty
}

set.seed(1234)
R <- array(runif(5*20),dim=c(5,20))
L <- array(runif(1000*5),dim=c(1000,5))
Y <- array(runif(1000*20),dim=c(1000,20))
ftv <- compute_fit(R,L,Y)
show(ftv)
show(val(ftv))
show(dvdx(ftv))

我回过头来看:

class: madness 
        d (norm((numeric - (numeric  %*% R)), 'f') + (sum(exp((numeric * R)), na.rm=FALSE) + numeric))
 calc: ------------------------------------------------------------------------------------------------ 
                                                      d R
  val: 207.6 ...
 dvdx: 4.214 4.293 4.493 4.422 4.672 2.899 2.222 2.565 2.854 2.718 4.499 4.055 4.161 4.473 4.069 2.467 1.918 2.008 1.874 1.942 0.2713 0.2199 0.135 0.03017 0.1877 5.442 4.81
1 5.472 5.251 4.674 1.933 1.62 1.79 1.902 1.665 5.232 4.435 4.789 5.183 5.084 3.602 3.477 3.419 3.592 3.376 4.109 3.937 4.017 3.816 4.2 1.776 1.784 2.17 1.975 1.699 4.365 4
.09 4.475 3.964 4.506 1.745 1.042 1.349 1.084 1.237 3.1 2.575 2.887 2.524 2.902 2.055 2.441 1.959 2.467 1.985 2.494 2.223 2.124 2.275 2.546 3.497 2.961 2.897 3.111 2.9 4.44
2 3.752 3.939 3.694 4.326 0.9582 1.4 0.8971 0.8756 0.9019 2.399 2.084 2.005 2.154 2.491 ...
 varx:  ...

      [,1]
[1,] 207.6

      [,1]  [,2]  [,3]  [,4]  [,5]  [,6]  [,7]  [,8]  [,9] [,10] [,11] [,12] [,13] [,14] [,15] [,16] [,17] [,18] [,19] [,20]  [,21]  [,22] [,23]   [,24]  [,25] [,26] [,27]
[1,] 4.214 4.293 4.493 4.422 4.672 2.899 2.222 2.565 2.854 2.718 4.499 4.055 4.161 4.473 4.069 2.467 1.918 2.008 1.874 1.942 0.2713 0.2199 0.135 0.03017 0.1877 5.442 4.811
     [,28] [,29] [,30] [,31] [,32] [,33] [,34] [,35] [,36] [,37] [,38] [,39] [,40] [,41] [,42] [,43] [,44] [,45] [,46] [,47] [,48] [,49] [,50] [,51] [,52] [,53] [,54]
[1,] 5.472 5.251 4.674 1.933  1.62  1.79 1.902 1.665 5.232 4.435 4.789 5.183 5.084 3.602 3.477 3.419 3.592 3.376 4.109 3.937 4.017 3.816   4.2 1.776 1.784  2.17 1.975
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[1,] 1.699 4.365  4.09 4.475 3.964 4.506 1.745 1.042 1.349 1.084 1.237   3.1 2.575 2.887 2.524 2.902 2.055 2.441 1.959 2.467 1.985 2.494 2.223 2.124 2.275 2.546 3.497
     [,82] [,83] [,84] [,85] [,86] [,87] [,88] [,89] [,90]  [,91] [,92]  [,93]  [,94]  [,95] [,96] [,97] [,98] [,99] [,100]
[1,] 2.961 2.897 3.111   2.9 4.442 3.752 3.939 3.694 4.326 0.9582   1.4 0.8971 0.8756 0.9019 2.399 2.084 2.005 2.154  2.491

请注意,导数是标量相对于5 x 20矩阵的导数,但在此处展平为矢量。 (不幸的是行向量。)