如何在学习中使用Mann-Whitney U检验

时间:2013-06-01 22:01:57

标签: python scipy scikit-learn

我有一个表(X,Y),其中X是矩阵,Y是类的向量。这是一个例子:

X = 0 0 1 0 1   and Y = 1
    0 1 0 0 0           1
    1 1 1 0 1           0

我想使用Mann-Whitney U测试来计算特征重要性(特征选择)

from scipy.stats import mannwhitneyu
results = np.zeros((X.shape[1],2))
for i in xrange(X.shape[1]):
    u, prob = mannwhitneyu(X[:,i], Y)
    results[i,:] = u, pro

我不确定这是正确还是不对?我为一些大表获得了大值,u = 990用于某些列。

1 个答案:

答案 0 :(得分:11)

我不认为使用Mann-Whitney U测试是进行特征选择的好方法。 Mann-Whitney测试两个变量的分布是否相同,它没有告诉你变量的相关性。例如:

>>> from scipy.stats import mannwhitneyu
>>> a = np.arange(100)
>>> b = np.arange(100)
>>> np.random.shuffle(b)
>>> np.corrcoef(a,b)
   array([[ 1.        , -0.07155116],
          [-0.07155116,  1.        ]])
>>> mannwhitneyu(a, b)
(5000.0, 0.49951259627554112) # result for almost not correlated
>>> mannwhitneyu(a, a)
(5000.0, 0.49951259627554112) # result for perfectly correlated

由于ab具有相同的分布,我们无法拒绝分布相同的原假设。

由于在功能选择中您正在尝试查找主要解释Y的功能,因此Mann-Whitney U对此没有帮助。