在Windows 7上安装R软件包

Question

在Windows 7 x64上，我安装了版本3.0.0的R.此外，我还将环境变量R_LIBS_USER设置为指向网络驱动器。在rgui.exe中，执行：

Sys.getenv("R_LIBS_USER")

输出我之前设置的相同值。同样来自R，将包安装到R_LIBS_USER指向的个人库中工作正常。到目前为止，非常好。

安装了RStudio版本0.97.551后，通过RStudio执行上述相同代码也会输出相同的值（如预期的那样）。但是，从RStudio，我尝试将软件包安装到个人库中失败了。该错误消息有效地表明RStudio无法写入由R_LIBS_USER定义的个人库。

在发布到stackoverflow之前，我检查了支持论坛的RStudio（http://support.rstudio.org/help/discussions/problems/4608-change-personal-library-for-installing-packages），其中管理员声明问题与R而不是RStudio有关。管理员继续引用代码

生成的RStudio文档

?.libPaths

在RStudio IDE中。管理员还通过链接http://support.rstudio.org/help/kb/troubleshooting/getting-help-with-r提供了其他指导。

在查看IDE生成的文档和论坛链接后，我确定我的环境设置正确。然而，RStudio仍然失败。

是否有人能够使用默认情况下的文件系统位置使用RStudio个人库？

我应该更多地澄清我的需求。最终部署此应用程序的环境禁止普通用户以管理员身份运行RStudio，因此将重点放在R_LIBS_USER个人库上。所以虽然我知道这会起作用，但对我来说这不是一个现实的选择。

我需要的是RStudio专门写入R_LIBS_USER而不是尝试写入R_HOME（我对我认为它实际上正在尝试做的假设。）

Answer 1

在.libPaths("~/your-lib-path-here")添加一行.Rprofile并重新启动R. .libPaths()让您可以编写和读取默认库集。

或者，如果你可以控制安装命令（即你需要你的库可用，但它不一定是默认的），大多数R命令如install.packages都有lib允许您手动指定要安装到的库的参数。

您可以考虑使用诸如Packrat之类的R包管理系统，该系统可以自动完成将应用程序的依赖项安装到私有库的工作，而无需手动设置它。 （完全披露，我是这个软件包的贡献者。）它在RStudio下工作。