Question

当尝试安装像ndl，minqa，RcppEigen，lme4等软件包时，我收到以下错误：

    install.packages("RcppEigen")
Installing package into ‘/home/matias/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.0’
(as ‘lib’ is unspecified)
probando la URL 'http://cran.at.r-project.org/src/contrib/RcppEigen_0.3.2.0.2.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 1251504 bytes (1.2 Mb)
URL abierta
==================================================
downloaded 1.2 Mb

* installing *source* package ‘RcppEigen’ ...
** package ‘RcppEigen’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** libs
g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG   -I"/home/matias/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.0/Rcpp/include"  -I../inst/include -fpic  -O3 -pipe  -g  -c RcppEigen.cpp -o RcppEigen.o
g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG   -I"/home/matias/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.0/Rcpp/include"  -I../inst/include -fpic  -O3 -pipe  -g  -c fastLm.cpp -o fastLm.o
g++ -shared -o RcppEigen.so RcppEigen.o fastLm.o Note: no visible binding for global variable '.Data' Note: no visible binding for global variable '.Data' -llapack -lblas -lgfortran -lm -lquadmath -L/usr/lib/R/lib -lR
g++: error: Note:: No existe el archivo o el directorio
g++: error: no: No existe el archivo o el directorio
g++: error: visible: No existe el archivo o el directorio
g++: error: binding: No existe el archivo o el directorio
g++: error: for: No existe el archivo o el directorio
g++: error: global: No existe el archivo o el directorio
g++: error: variable: No existe el archivo o el directorio
g++: error: '.Data': No existe el archivo o el directorio
g++: error: Note:: No existe el archivo o el directorio
g++: error: no: No existe el archivo o el directorio
g++: error: visible: No existe el archivo o el directorio
g++: error: binding: No existe el archivo o el directorio
g++: error: for: No existe el archivo o el directorio
g++: error: global: No existe el archivo o el directorio
g++: error: variable: No existe el archivo o el directorio
g++: error: '.Data': No existe el archivo o el directorio
make: *** [RcppEigen.so] Error 1
ERROR: compilation failed for package ‘RcppEigen’
* removing ‘/home/matias/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.0/RcppEigen’

The downloaded source packages are in
    ‘/tmp/RtmpzLOC7E/downloaded_packages’
Mensajes de aviso perdidos
In install.packages("RcppEigen") :
  installation of package ‘RcppEigen’ had non-zero exit status

我尝试重新安装R：

 sudo apt-get remove --purge r-base r-base-dev r-base-core
 sudo apt-get install r-base r-base-dev

我删除了R文件夹中的所有内容，但问题仍然存在。我接下来可以尝试什么？

Answer 1

我远离R专家，但我在安装minqa时遇到了类似的问题，这是由于〜/ .Rprofile文件中的欢迎消息。事实证明（由于我不知道的原因）minqa的C ++编译似乎将stdout直接传递给g ++，这是C ++编译器。

您可以在错误消息中看到：

g++: error: Note:: No existe el archivo o el directorio
g++: error: no: No existe el archivo o el directorio
g++: error: visible: No existe el archivo o el directorio
g++: error: binding: No existe el archivo o el directorio
g++: error: for: No existe el archivo o el directorio
g++: error: global: No existe el archivo o el directorio
g++: error: variable: No existe el archivo o el directorio
g++: error: '.Data': No existe el archivo o el directorio

正在产生消息“注意：全局变量'。'''没有可见的绑定，它直接传递给g ++。如果你能以某种方式抑制这个警告信息，我的猜测是minqa将会愉快地编译。

编辑：我刚刚意识到你通过重新安装Ubuntu解决了这个问题。哦，好吧。

Answer 2

看起来非常紧张。

现在，我在Ubuntu上开发/维护这些，所以除非你以某种方式炸毁你的系统，否则你很有可能让它工作。

首先尝试更简单的方法。在R中，请执行：

 R> library(Rcpp)
 R> evalCpp("2+2")

你能得到我们期望的答案吗？如果没有，则表示您未进行编译。安装r-base-dev包作为开始。

如果everthing else失败，请使用我为lme4，RcppEigen，Rcpp，...维护的prebuild包装。

Answer 3

没有看到你的代码，就不可能说了。但是，对于现在已弃用新R版本的软件包，可能会出现这些错误。尝试：

install.packages("ndl")

另外，确保这些是包裹的名称，而不仅仅是它们提供的功能......

Answer 4

我通过重新安装ubuntu解决了这个问题。

Answer 5

在.Rprofile文件中，删除第一行：＆＃34; cat（＆＃34; .Rprofile：设置fla repositoryn＆＃34;）＆＃34;。这将解决问题。您可以通过以下方式完成：

sudo gedit ~/.Rprofile

并删除第一行

Answer 6

以防有人遇到类似的相关错误：

public class TypeRegistry : Registry
{
    public TypeRegistry()
    {
        For<ILogger>().Singleton().Use<Log4NetLogger>();
        Policies.FillAllPropertiesOfType<ILogger>().Use<Log4NetLogger>();
    }
}

这是因为在clang: error: no such file or directory: 'Running' clang: error: no such file or directory: 'R' clang: error: no such file or directory: 'version' clang: error: no such file or directory: '3.2.0' clang: error: no such file or directory: '(2015-04-16)' clang: error: -E or -x required when input is from standard input clang: error: no such file or directory: 'Full' clang: error: no such file or directory: 'of' clang: error: no such file or directory: 'Ingredients' make: *** [minqa.so] Error 1 ERROR: compilation failed for package ‘minqa’中包含了自定义启动消息：

~/.Rprofile

暂时删除.First <- function(){ cat('\nRunning', R.Version()$version.string, '-', R.Version()$nickname, "\n\n") }会导致~/.Rprofile成功编译。

安装包失败

6 个答案: