CummeRbund csHeatmap:调整基因id文本大小的方法?

时间:2013-04-08 01:08:30

标签: r ggplot2 bioconductor

我想知道是否有人知道如何改变R包CummeRbund中csHeatmap()函数生成的热图的基因id文本标签?我知道这是一个ggplot对象,但我无法找到方法1)按照图像中呈现的顺序提取基因ID或2)修改它们的相对大小。现在,文本大小太大而无法读取。

有没有人遇到过这个问题?

任何想法都将不胜感激。谢谢!

1 个答案:

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想想我在一堆谷歌之后想出了这个。你基本上就像在ggplot中那样将主题传递给对象......

hmap <- csHeatmap(myGenes,cluster='both')
hmap <- hmap + theme(axis.text.x=element_text(size=14),axis.text.y=element_text(size=6))

myGenes是你的CuffGeneSet的名称。

祝你好运。