用于一个预测器案例的GAMens包

时间:2012-02-28 16:46:04

标签: r

我正在尝试将GAMens包用于一个非常简单的人工数据集的“一维数据集”(一个预测器和一个响应):

library(GAMens)
trainingdata <- read.table("D:/data.txt", header = TRUE, sep="\t")
trainingdata.GAMrsm <- GAMens(class~., trainingdata, 1,  autoform=TRUE, iter=10, rsm=FALSE)

不幸的是我得到了:

[.data.frame中的错误(data ,, as.character(formula [[2]])):   选择了未定义的列

也许我错过了一些东西但是应该可以让这个用于一维情况('维度'更好一个工作正常)。感谢。

编辑:

这是人工数据的生成方式:

n.site <- 150

    X1<- sort(runif(n = n.site, min = -1, max =1))

    xb <- 0.0 + 3.0*X1 

    occ.prob <- 1/(1+exp(-xb))

    true.presence <- rbinom(n = n.site, size = 1, prob = occ.prob)

    data <- data.frame(X1, true.presence)

    write.matrix(data, file = "data.txt", sep = "\t")

或者您可以在此处下载数据:

Data

2 个答案:

答案 0 :(得分:2)

您的data输入没有名为“class”的列,因此您使用的公式class ~ .无效。当然,错误信息不是很有用......

这似乎有效(但慢慢地,它在10分钟后仍在运行):

trainingdata.GAMrsm&lt; - GAMens(true.presence~X1,data,1,autoform = TRUE,iter = 10,rsm = FALSE)

答案 1 :(得分:1)

该问题已在新版本的软件包中解决。请通过CRAN存储库下载GAMens软件包的1.1.2版本。

祝你好运