在我程序最热门的部分(90%的时间根据gprof),我需要将一个数组A加到另一个B中。两个数组都是2 ^ n(n是18..24)大小并保持一个整数(为简单起见,实际存储的元素是mpz_t或小int数组)。求和规则:对于0..2 ^ n-1中的每个i,设置B[i] = sum (A[j])
,其中j
是位向量,j & ~ i == 0
(换句话说,第k位)如果j
的第k位不是1,则任何i
都不能设置为1。
我当前的代码(这是最内层循环的主体)在2 ^(1.5 * n)和的时间内执行此操作,因为我将迭代每个i on(平均)2 ^(n / 2)个元素A。
int A[1<<n]; // have some data
int B[1<<n]; // empty
for (int i = 0; i < (1<<n); i++ ) {
/* Iterate over subsets */
for (int j = i; ; j=(j-1) & i ) {
B[i] += A[j]; /* it is an `sum`, actually it can be a mpz_add here */
if(j==0) break;
}
}
我的提到,几乎所有的金额都是从价值中重新计算出来的,这是前面总结的。我建议,可以有代码,在n* 2^n
总和时执行相同的任务。
我的第一个想法是B[i] = B[i_without_the_most_significant_bit] + A[j_new]
;其中j_new只是j在'1'状态下具有来自i的最重要位。这减少了我的时间,但这还不够(实际问题大小仍然是几小时和几天):
int A[1<<n];
int B[1<<n];
B[0] = A[0]; // the i==0 will not work with my idea and clz()
for (int i = 1; i < (1<<n); i++ ) {
int msb_of_i = 1<< ((sizeof(int)*8)-__builtin_clz(i)-1);
int i_wo_msb = i & ~ msb;
B[i] = B[i_wo_msb];
/* Iterate over subsets */
for (int j_new = i; ; j_new=(j_new-1) & i ) {
B[i] += A[j_new];
if(j_new==msb) break; // stop, when we will try to unset msb
}
}
你能建议更好的算法吗?
附加图像,对于n = 4,每个i的i和j的总和:
i j`s summed
0 0
1 0 1
2 0 2
3 0 1 2 3
4 0 4
5 0 1 4 5
6 0 2 4 6
7 0 1 2 3 4 5 6 7
8 0 8
9 0 1 8 9
a 0 2 8 a
b 0 1 2 3 8 9 a b
c 0 4 8 c
d 0 1 4 5 8 9 c d
e 0 2 4 6 8 a c e
f 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 a b c d e f
注意数字的相似性
PS msb魔法来自这里:Unset the most significant bit in a word (int32) [C]
答案 0 :(得分:4)
划分和征服任何人?现在不到位。
void sums(int *a, int n, int *b) {
if (n <= 0) {
*b = *a;
return;
}
int m = 1 << (n - 1);
sums(a, n - 1, b);
sums(a + m, n - 1, b + m);
for (int i = 0; i < m; i++) {
b[m + i] += b[i];
}
}