使用igraph创建二部图

时间:2019-11-01 11:55:33

标签: r graph igraph bipartite

我正在尝试使用以下矩阵创建二部图:

    G1  G2  G3  G4  G5  G6
virus1  0   1   1   0   1   0
virus2  1   1   0   0   0   0
virus3  0   1   0   0   0   0
virus4  1   0   0   0   0   0
virus5  0   1   0   1   0   1
virus6  1   1   0   1   0   0

这是我目前使用的代码:

install.packages("igraph")
library(igraph)
matrice = read.table("C:/Users/loisv/Desktop/test4.txt",sep="\t", row.names=NULL,header=TRUE)
net2 <- graph_from_incidence_matrix(matrice)
plot(net2, vertex.size=7, layout=layout_as_bipartite)

我的代码将第一行作为标头,但不考虑第一列(virus1,virus2 ...)

The dataframe containing the error

这是我现在得到的图形: The graph

能帮我吗?

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