加权外部乘积的向量化

时间:2019-09-27 21:55:45

标签: c++ vectorization eigen

我希望加快近似加权协方差的计算。

具体地说,我有一个Eigen::VectorXd(N) w和一个Eigen::MatrixXd(M,N) points。我想计算w(i)*points.col(i)*(points.col(i).transpose())的总和。

我正在使用for循环,但想看看我是否可以更快:

Eigen::VectorXd w = Eigen::VectorXd(N) ;
Eigen::MatrixXd points = Eigen::MatrixXd(M,N) ;
Eigen::MatrixXd tempMatrix = Eigen::MatrixXd(M,M) ;
for (int i=0; i < N ; i++){
    tempMatrix += w(i)*points.col(i)*(points.col(i).transpose());
}

期待看到可以做什么!

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

以下方法应该起作用:

Eigen::MatrixXd tempMatrix; // not necessary to pre-allocate
// assigning the product allocates tempMatrix if needed
// noalias() tells Eigen that no factor on the right aliases with tempMatrix
tempMatrix.noalias() = points * w.asDiagonal() * points.adjoint();

或直接:

Eigen::MatrixXd tempMatrix = points * w.asDiagonal() * points.adjoint();

如果M很大,仅计算一侧并复制(如果需要)可能会明显更快:

Eigen::MatrixXd tempMatrix(M,M);
tempMatrix.triangularView<Eigen::Upper>() = points * w.asDiagonal() * points.adjoint();
tempMatrix.triangularView<Eigen::StrictlyLower>() = tempMatrix.adjoint();

请注意,对于非复杂标量,.adjoint()等效于.transpose(),但是对于前者,如果使用points,则代码也可以正常工作;如果使用MatrixXcd,则代码的效果也不错(如果结果必须是自伴的,则w必须仍然是实数。

此外,请注意,以下内容(来自原始代码)并未将所有条目都设置为零:

Eigen::MatrixXd tempMatrix = Eigen::MatrixXd(M,M);

如果要这样做,您需要写:

Eigen::MatrixXd tempMatrix = Eigen::MatrixXd::Zero(M,M);