从Stan ADVI中提取参数估计值的方差

时间:2019-08-14 21:52:22

标签: stan

我正在使用stancmd,这是进行贝叶斯推理的好工具。就我而言,我确实需要推断参数的均值和方差信息。我了解这对于MCMC是可能的,只需从out.csv中读取stddev。例如,

# Output
#         mean se_mean   sd   2.5%    25%    50%    75%  97.5% 
n_eff Rhat
# alpha   3.33    0.01 0.40   2.57   3.06   3.33   3.59   4.13  
1229    1
# beta    2.14    0.01 0.40   1.37   1.89   2.14   2.40   2.98  
1470    1
# sigma   1.92    0.01 0.27   1.45   1.71   1.90   2.09   2.51  
1211    1
# lp__  -31.92    0.05 1.30 -35.27 -32.50 -31.63 -30.96 -30.43   
769    1

如何使用变分推理来做同样的事情?我只能从标准输出文件中获取均值。

非常感谢

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