Cox回归中的分层变量的参数估计和方差(分层/生存包)

时间:2017-08-25 15:17:28

标签: r survival-analysis cox-regression

我使用survival包运行Cox回归来计算暴露A的死亡率风险比。我发现age变量违反了比例风险假设(cox.zph)并使用strata(age)对其他模型中的年龄进行分层。

我需要age变量的参数估计,以及方差和协方差矩阵(计算速率提升期)...而且我不知道在哪里找到它们!

我错过了什么,或者我误解了strata正在做什么?

这是一个可重现的示例,使用lung包中的survival数据。

library(survival)    

我创建了生存对象并使用非分层年龄变量进行第一次Cox回归。

lung$SurvObj <- with(lung, Surv(time, status == 2))
coxreg1 <- coxph(SurvObj ~ age + sex, data =  lung)  

因此,我得到参数估计的系数,方差和协方差矩阵。

>   coxreg1$coefficients
        age         sex 
 0.01704533 -0.51321852 

> vcov(coxreg1)
             age          sex
age 8.506877e-05 8.510634e-05
sex 8.510634e-05 2.804217e-02

现在,如果使用分层年龄变量进行第二次回归,我不会得到任何系数估计,方差或协方差。

coxreg2 <- coxph(SurvObj ~ strata(age) + sex, data =  lung)

> coxreg2$coefficients
     sex 
-0.64471 

> vcov(coxreg2)
          sex
sex 0.0449369

感谢您的帮助!

1 个答案:

答案 0 :(得分:2)

当您使用变量进行分层时,您不会得到任何系数估计值。相反,估计不同年龄组的单独基线危害。 分层Cox回归的本质是拟合每个层次具有不同基线危险的模型。