Question

我想使用熊猫从HDF5文件中检索表。

在找到一些参考之后，我尝试使用以下方法打开文件：

df = pd.read_hdf('data/test.h5', g_name),

其中g_name是我要检索的对象的路径，即表TAB1，例如MAIN / Basic / Tables / TAB1。

g_name的检索方法如下：

def get_all(name):
    if 'TAB1' in name:
        return name

with h5py.File('data/test.h5') as f:
    g_name = f.visit(get_all)
    print(g_name)
    group = f[g_name]
    print(type(group))

我也尝试过检索对象本身，如上面的代码片段所示，但是对象类型是我如何将其转换为可以在熊猫中读取为数据框的内容？

在第一种情况下，出现以下错误： “如果对象不存在，则无法创建存储器”

如果路径与搜索过程中检索到的路径相同，我不明白为什么它找不到对象。

Answer 1

我找到了以下解决方案：

hf = h5py.File('data/test.h5')
data = hf.get('MAIN/Basic/Tables/TAB1')
result = data[()]

# This last step just converts the table into a pandas df
df = pd.DataFrame(result)

如何使用熊猫访问HDF5中的嵌套表

1 个答案: