ImportError HDFStore需要PyTables没有名为tables的模块

Question

import pandas as pd
dfs = pd.HDFStore('xxxxx.h5')

抛出此错误：

"ImportError: HDFStore requires PyTables, "No module named tables" problem importing"

我尝试安装PyTables，需要Cython。 我安装了Cython 0.21，但它抛出一个错误，说明Cython应该大于0.13

这是我得到的日志：

".. ERROR:: You need Cython 0.13 or greater to compile PyTables!

----------------------------------------
Cleaning up...
Command python setup.py egg_info failed with error code 1 in /private/tmp/pip_build_root/tables
Storing debug log for failure in /Users/nikhilsahai/Library/Logs/pip.log
Nikhils-MacBook-Pro:~ nikhilsahai$ sudo pip install cython
Requirement already satisfied (use --upgrade to upgrade): cython in /Library/Python/2.7/site-packages/Cython-0.21-py2.7-macosx-10.9-intel.egg
Cleaning up..."

请指导我如何解决此问题。

Answer 1

只需使用以下内容更新"open_basedir restriction in effect"

pytables

为我工作。

Answer 2

使用 HDFStore 时，我也遇到了同样的错误。我尝试了上面指定的所有步骤并花了很多时间来寻找解决方案，但没有成功。

然后我下载并安装了MiniConda。然后我使用下面的命令来安装pytables。

conda install -c conda-forge pytables

请参阅以下屏幕截图。

Answer 3

在Ubuntu上，我使用此命令解决了这个问题：

sudo apt-get install python3-tables

请注意，我使用的是Python 3

Answer 4

你可以在任何操作系统上使用pip：

python -m pip install tables

您可以查看官方文档，了解更多安装方法 http://www.pytables.org/usersguide/installation.html

Answer 5

正如TomAugspurger所提到的......似乎最新版本的pytables存在一个错误。您可以通过执行以下命令来安装当前的开发版本：

sudo pip install git+https://github.com/PyTables/PyTables

如果它解决了问题，那么应该关闭这个问题：）

Answer 6

你必须安装pytables：

conda install pytables

Answer 7

在Windows上，使用此命令可能是一个不错的选择：

pip安装表-3.2.2-cp34-cp34m-win_amd64.whl

---您可以从http://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/#numpy

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