创建phyloseq对象的步骤

时间:2019-07-11 14:25:38

标签: ggplot2 rstudio phyloseq

Image of code + results我正在尝试创建一个phyloseq对象,但是在匹配otu_table的列名和映射文件(数据)时遇到错误-有什么建议吗?

我正在尝试创建phyloseq对象,但是最初我是使用read.delim来设置地图文本文件的-因此,我无法创建phyloseq对象,因此提出了一个解决方案,我设置了地图文件使用read.table,这使我可以进一步创建预期的结果。但是,当我尝试检查otu_table的列名是否与Sample Subject的列名匹配时,会产生错误,我不确定如何更正以获得“ TRUE”语句-任何建议/建议/解决方案?

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