如何在秘籍图中获取连续的比例尺

时间:2019-07-11 10:11:13

标签: r pheatmap

我正在研究微阵列数据,为了表示数据,我们选择使用热图。我也用了pheatmap。

使用代码

my_palette <- colorRampPalette(c("green", "black", "red"))(n = 9999)

pheatmap(list, color = my_palette, cluster_rows=T, cluster_cols=F, show_rownames=F, main="All Conditions", border_color=NA, labels_col=c("SKF","ABeta","CSP","TTK21"))

我获得了the heatmap

您可以在图像的右上角看到比例尺,它在-2.5的值周围显示白色间隙

请及时通知我有关代码中的任何错误,因为我已根据可用代码设置了调色板。

编辑:示例数据(存储为矩阵,命名列表)

  

SKF基因ABeta CSP TTK21

     

A 0.05466 -0.0154254 0.011404 0.96582

     

B 1.05325 0.015212 0.22360 10.00140254

     

C 2.002102 20.200052 1.214325 1.25355

     

D 0.05466 -0.0154254 0.011404 0.96582

     

E 1.05325 0.015212 0.22360 10.00140254

     

F 2.002102 20.200052 1.214325 1.25355

     

G 0.05466 -0.0154254 0.011404 0.96582

     

H 1.05325 0.015212 0.22360 10.00140254

     

我2.002102 20.200052 1.214325 1.25355

P.S。在样本中,我已经重复了前三个基因的数据三次,但是可以理解这个问题。如上所示,热图的模式将无法重现,但是白色间隙仍然存在。

谢谢。

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