我已经使用glm在R中进行了logistic回归,根据性别(Gen),吸烟状况(Smoke1993),高血压(HT1993),高胆固醇预测1993年的个体在2004年(Arth2004)患有关节炎的可能性(HC1993)和BMI(BMI1993)在1993年的状态。我的样本大小为n = 7896。除BMI(连续的数字)外,所有变量都是false和true的二进制变量,0和1。对于性别,男性= 1,女性= 0。
当我在R中运行回归时,我得到了很好的p值,但是当我实际使用回归进行预测时,对于非常标准的人,我得到的值常常大于一个。对于较大的代码块,我深表歉意,但我认为更多信息可能会有所帮助。
library(ResourceSelection)
library(MASS)
data=read.csv(file.choose())
data$Arth2004 = as.factor(data$Arth2004)
data$Gen = as.factor(data$Gen)
data$Smoke1993 = as.factor(data$Smoke1993)
data$HT1993 = as.factor(data$HT1993)
data$HC1993 = as.factor(data$HC1993)
data$BMI1993 = as.numeric(data$BMI1993)
logistic <- glm(Arth2004 ~ Gen + Smoke1993 + BMI1993 + HC1993 + HT1993, data=data, family="binomial")
summary(logistic)
hoslem.test(logistic$y, fitted(logistic))
confint(logistic)
min(data$BMI1993)
median(data$BMI1993)
max(data$BMI1993)
e=2.71828
输出如下:
Call:
glm(formula = Arth2004 ~ Gen + Smoke1993 + BMI1993 + HC1993 +
HT1993, family = "binomial", data = data)
Deviance Residuals:
Min 1Q Median 3Q Max
-2.0362 -1.0513 -0.7831 1.1844 1.8807
Coefficients:
Estimate Std. Error z value Pr(>|z|)
(Intercept) -2.346104 0.158043 -14.845 < 2e-16 ***
Gen1 -0.748286 0.048398 -15.461 < 2e-16 ***
Smoke19931 -0.059342 0.064606 -0.919 0.358
BMI1993 0.084056 0.006005 13.997 < 2e-16 ***
HC19931 0.388217 0.047820 8.118 4.72e-16 ***
HT19931 0.341375 0.058423 5.843 5.12e-09 ***
---
Signif. codes: 0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1
(Dispersion parameter for binomial family taken to be 1)
Null deviance: 10890 on 7895 degrees of freedom
Residual deviance: 10309 on 7890 degrees of freedom
AIC: 10321
Number of Fisher Scoring iterations: 4
Hosmer and Lemeshow goodness of fit (GOF) test
data: logistic$y, fitted(logistic)
X-squared = 18.293, df = 8, p-value = 0.01913
Waiting for profiling to be done...
2.5 % 97.5 %
(Intercept) -2.65715966 -2.03756775
Gen1 -0.84336906 -0.65364134
Smoke19931 -0.18619647 0.06709748
BMI1993 0.07233866 0.09588198
HC19931 0.29454661 0.48200673
HT19931 0.22690608 0.45595006
[1] 18
[1] 26
[1] 43
一名非吸烟女性,体重指数中位数(26),高血压和高胆固醇血症会导致以下情况:
e^(26*0.084056+1*0.388217+1*0.341375-0*0.748286-0*0.059342-2.346104)
[1] 1.7664
我认为该问题与BMI有某种联系,因为这是唯一的数字变量。有谁知道为什么这种回归产生的概率大于1?
答案 0 :(得分:1)
默认情况下,family = "binomial"
使用logit
链接功能(请参见?family
)。因此,您寻找的概率为1.7664 / (1+1.7664)
。