RPy2无法导入_rinterface_capi

时间:2019-05-23 13:07:09

标签: python rpy2

我已经好几年没有使用RPy2了(然后我只玩了一段时间)。但是,我现在想更加认真地开始使用Python和R,并决定重新探索RPy2库。

我正在使用运行El Capitan的Mac。我使用Python 3.4.4创建了一个新的虚拟环境(称为env34),并使用get-pip.py安装了最新版本的pip(19.1.1)。然后,我将numpy,pandas和jupyter安装到激活的环境中。我还点安装了RPy2(但必须包括一个受信任的主机标志):

(env34) $ pip install rpy2 --trusted-host=https://pypi.org/simple/cffi

我还在Applications文件夹的默认位置安装了最新版本的R(3.6.0),并编辑了.bash_profile以添加以下内容来创建RHOME环境变量:

RHOME="/Library/Frameworks/R.framework/Resources"
export RHOME

现在,当我在虚拟环境中启动Python时,可以毫无问题地导入rpy2。但是,当我尝试使用以下命令导入rpy2.robjects时,我将尝试遵循http://heather.cs.ucdavis.edu/~matloff/rpy2.html给出的教程。

>>> from rpy2.robjects import r

我收到以下错误:

Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
  File "/path_to_virtual_environment/env34/lib/python3.4/site-packages/rpy2/robjects/__init__.py", line 14, in <module>
    import rpy2.rinterface as rinterface
  File "/path_to_virtual_environment/env34/lib/python3.4/site-packages/rpy2/rinterface.py", line 5, in <module>
    import rpy2.rinterface_lib._rinterface_capi as _rinterface
  File "/path_to_virtual_environment/env34/lib/python3.4/site-packages/rpy2/rinterface_lib/_rinterface_capi.py", line 8, in <module>
    from . import conversion
  File "/path_to_virtual_environment/env34/lib/python3.4/site-packages/rpy2/rinterface_lib/conversion.py", line 8, in <module>
    from . import _rinterface_capi as _rinterface
ImportError: cannot import name '_rinterface_capi'

据我所知,消息中引用的所有文件都位于正确的位置。

任何人都可以解释此错误消息并提供解决方法吗?

谢谢。

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