Question

我在Anaconda中使用Jupyter笔记本，并尝试使用pvclust对我的数据执行分层聚类。我的代码：

from rpy2.robjects import r, pandas2ri
from rpy2.robjects.packages import importr
pandas2ri.activate()
base = importr("base")
pvclust = importr("pvclust")

但是我得到了错误：

RRuntimeError                             Traceback (most recent call last)
<ipython-input-51-291b18105962> in <module>()
      3 pandas2ri.activate()
      4 base = importr("base")
----> 5 pvclust = importr("pvclust")
      6 # data = robjects.DataFrame.from_csvfile(filepath + folders[0]      + '\\vcfA_filled.csv')
      7 # data

~\Anaconda3\lib\site-packages\rpy2-2.9.1-py3.6-win-amd64.egg\rpy2  \robjects\packages.py in importr(name, lib_loc, robject_translations, signature_translation, suppress_messages, on_conflict, symbol_r2python,  symbol_check_after, data)
    451     if _package_has_namespace(rname, 
    452                               _system_file(package = rname)):
--> 453         env = _get_namespace(rname)
    454         version = _get_namespace_version(rname)[0]
    455         exported_names = set(_get_namespace_exports(rname))

RRuntimeError: Error in loadNamespace(name) : there is no package called 'pvclust'

似乎我需要先安装pvclust？但是我正在使用anaconda启动的jupyter笔记本（python3.6），并且对如何预装这样的R包然后从rpy2导入感到困惑？

P.S。是否有任何Python包可以执行带有p值的层次聚类？我需要做的就是使用一些可以引导我的数据并使用p值对数据进行聚类的函数。

非常感谢。

无法在python3.6（Jupyter笔记本）中使用rpy2导入pvclust

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