Question

我尝试导入rpy2时出错。这是代码和错误。

>>> import pandas.rpy.common
Traceback (most recent call last):  

File "C:\PF\WinPython-64bit-3.3.3.3\python-3.3.3.amd64\lib\site-packages\IPython\core\interactiveshell.py", line 2828, in run_code
    exec(code_obj, self.user_global_ns, self.user_ns)

File "<ipython-input-148-c258a0f70d44>", line 1, in <module>
import pandas.rpy.common

File "C:\PF\WinPython-64bit-3.3.3.3\python-3.3.3.amd64\lib\site-packages\pandas\rpy\common.py", line 14, in <module>
from rpy2.robjects.packages import importr

ImportError: No module named 'rpy2'

可能是什么问题？我正在使用python版本3.3.3和pandas版本0.13.1

修改

试图单独安装rpy2。

直接使用python setup.py install给了我一个os没有模块popen3的错误。

直接从Christoph Gohlke网站http://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/安装exe（rpy2-2.3.9.win32-py3.3.exe）运行正常。但是，如果我尝试import pandas.rpy.common as com，那么我会收到以下错误（在from rpy2.rinterface._rinterface import *加载DLL的问题：

Traceback (most recent call last):
  File "C:\PF\WinPython-64bit-3.3.3.3\python-3.3.3.amd64\lib\site-packages\IPython\core\interactiveshell.py", line 2828, in run_code
exec(code_obj, self.user_global_ns, self.user_ns)

  File "<ipython-input-10-63ebebefea80>", line 1, in <module>
import pandas.rpy.common as com

  File "C:\PF\WinPython-64bit-3.3.3.3\python-3.3.3.amd64\lib\site-    packages\pandas\rpy\common.py", line 14, in <module>

from rpy2.robjects.packages import importr

  File "C:\PF\WinPython-64bit-3.3.3.3\python-3.3.3.amd64\lib\site-packages\rpy2\robjects\__init__.py", line 15, in <module>

    import rpy2.rinterface as rinterface
  File "C:\PF\WinPython-64bit-3.3.3.3\python-3.3.3.amd64\lib\site-packages\rpy2\rinterface\__init__.py", line 103, in <module>

    from rpy2.rinterface._rinterface import *
ImportError: DLL load failed: %1 is not a valid Win32 application.

修改

终于解决了。似乎添加R_HOME和R_USER环境变量就可以了。

Answer 1

RPy2是与Pandas（主页here）分开的项目，因此您必须单独安装它。您应该可以执行pip install rpy2，然后重新启动Python并重试。

Answer 2

这可能不会直接适用于您的问题，但自从pandas和rpy2升级后，其界面已经更改。为了进行设置，您现在必须：

from rpy2.robjects import r, pandas2ri

pandas2ri.activate()

现在，为了将Pandas数据帧更改为R数据帧，必须使用pandas2ri.py2ri()，或者如果要将R数据帧更改为Pandas数据帧，则必须使用pandas2ri.ri2py()。更多信息可以在https://pandas.pydata.org/pandas-docs/stable/r_interface.html找到。

Answer 3

好吧，首先你必须安装rpy2。如果您使用conda，可以使用以下命令

进行

conda install -c r rpy2

然后，如果您想在Jupyter Notebook环境中使用R，您可以使用

激活R.

%load_ext rpy2.ipython

Answer 4

在我的情况下，当我使用命令在Anaconda Prompt中安装它时，它有效：

conda install -m rpy2

之后我不得不从rpy2-2.9.0-py3.6-win32.egg（安装到的文件夹）移动 rpy2 目录，因为它在安装后无法识别它。。并仅将 rpy2 文件夹移至以下路径：

C：\用户.. \ Anaconda3 \ LIB \站点包（从中调用所有包）

这解决了我的问题。

Answer 5

看起来像是ppyas 接口到rpy2。另外，您还需要在系统上安装rpy2。我没有rpy2，所以我很容易检查这个：

In [1]: import pandas.rpy.common
(...)
ImportError: No module named rpy2.robjects.packages


In [2]: import rpy2
(...)
ImportError: No module named rpy2

我用pip安装了它：

$ pip install rpy2

In [1]: import pandas.rpy.common

有效！它import rpy2适合您，但import pandas.rpy.common 不，那么问题可能会更加微妙。

Answer 6

在我的情况下，它最初并没有用conda安装它。我通过首先改变活动环境来解决它。

source activate [environment Name]
conda install -c r rpy2=2.8.5

Answer 7

我最近遇到了类似的问题。我试图使用anaconda版本的python（ 3.6.3 ）安装rpy2。下面，提到的命令对我有用，

* python3 -m conda install rpy2

Answer 8

我使用conda install -m rpy2安装了

并将rpy2的目录从rpy2-2.9.1-py3.6-win-amd64.egg文件夹移动到导入期间调用软件包的路径，然后它起作用。

rpy2导入无效

8 个答案: