Seurat RunUMAP无法在带有rpy2的python中工作

Question

我正在conda创建的rmain虚拟环境中工作。当我使用umap在rstudio中运行Seurat时，一切正常。但是，我需要使其与python中的rpy2一起使用：

from rpy2.robjects.packages import importr
seuratLib = importr('Seurat')

seurat_object = seuratLib.RunUMAP(seurat_object, **{'reduction.use': 'pca', 'dims.use': np.arange(1, 11)})

调用RunUMAP函数时，出现以下错误：

  

SystemError：_heapq的初始化未返回扩展模块

我googled，发现_heapq可能与julia语言有关，因此我用conda-forge安装了它，但没有解决问题。