如何让Snakemake在空试中仅显示Job counts
字段?在执行实际运行时,这是Snakemake在开始作业之前输出的第一个信息。
当前,获得工作计数的方法是在没有-n
标志的情况下运行Snakemake,然后立即将其取消(^C
),但这远非理想。
让空运行完成将在最后输出Job counts
,但这对具有成百上千个工作机会的管道不可行。
所需的输出:
$ snakemake -n --someflag
Job counts:
count jobs
504 BMO
1 all
504 fit_nbinoms
517 motifs_in_peaks
503 motifs_outside_peaks
2029
$