绘制由3D numpy数组表示的3d体积数据

Question

我已经看到vtkplotter支持多种体积图像格式，但是它支持绘制numpy数组吗？我有一个.mhd格式的图像，我将其转换为.npz文件，并希望使用上述库进行绘制。有办法吗？

import numpy as np
data = np.zeros((3,3,3))
# how to plot this?

如果您知道适用于医学分析的其他可视化体积数据的工具，请告知。我尝试过mayavi，但是它消耗了太多内存，导致计算机崩溃。

Answer 1

您可以使用numpy_support将numpy数组转换为vtkImageData（即VTK 3D图像）。

下面是一个示例，关于类型转换有一些小小的警告：我认为这无关紧要，但我不是python大师...

create

...并且要可视化vtk体积数据，可以使用Paraview。