从3D numpy数组创建3D绘图

时间:2012-09-13 20:53:10

标签: python numpy matplotlib

好的,所以我觉得应该有一种简单的方法来使用matplotlib创建一个三维散点图。我有一个3D numpy数组(dset)0,我不想要一个点和1我在哪里,基本上要绘制它现在我必须逐步执行三个for:循环:< / p>

for i in range(30):
    for x in range(60):
        for y in range(60):
            if dset[i, x, y] == 1:
                ax.scatter(x, y, -i, zdir='z', c= 'red')

有关如何更有效地完成此任务的任何建议?任何想法都将不胜感激。

2 个答案:

答案 0 :(得分:22)

如果你有dset这样的,并且想要获得1值,则可以使用nonzero,它“返回一个数组元组,每个维度一个a,包含该维度中非零元素的索引。“

例如,我们可以创建一个简单的3d数组:

>>> import numpy
>>> numpy.random.seed(29)
>>> d = numpy.random.randint(0, 2, size=(3,3,3))
>>> d
array([[[1, 1, 0],
        [1, 0, 0],
        [0, 1, 1]],

       [[0, 1, 1],
        [1, 0, 0],
        [0, 1, 1]],

       [[1, 1, 0],
        [0, 1, 0],
        [0, 0, 1]]])

并找到非零元素的位置:

>>> d.nonzero()
(array([0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 1, 2, 2, 2, 2]), array([0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 1, 2]), array([0, 1, 0, 1, 2, 1, 2, 0, 1, 2, 0, 1, 1, 2]))
>>> z,x,y = d.nonzero()

如果我们想要更复杂的剪切,我们可以做类似(d > 3.4).nonzero()之类的东西,因为True的整数值为1并且计为非零。

最后,我们绘制:

import matplotlib.pyplot as plt
from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D
fig = plt.figure()
ax = fig.add_subplot(111, projection='3d')
ax.scatter(x, y, -z, zdir='z', c= 'red')
plt.savefig("demo.png")

demo 3d image

答案 1 :(得分:0)

如果您想避免使用nonzero选项(例如,如果您有一个3D numpy数组,其值应该是数据点的颜色值),则可以执行以下操作:使用ndenumerate保存一些代码行。

您的示例可能会变成:

for index, x in np.ndenumerate(dset):
    if x == 1:
        ax.scatter(*index, c = 'red')

我想关键是您不需要嵌套for循环即可遍历多维numpy数组。