通过最小地理空间距离(R)匹配两个数据集

时间:2019-02-08 22:52:24

标签: r geosphere

我有以下两个数据集:

houses <- data.table(house_number = c(1:3),
                     lat_decimal = seq(1.1, 1.3, by = 0.1),
                     lon_decimal = seq(1.4, 1.6, by = 0.1))
stations <- data.table(station_numer = c(1:11),
                       lat_decimal = seq(1, 2, by = 0.1),
                       lon_decimal = seq(2, 3, by = 0.1))

我想将housesstations合并在一起,使生成的station_number是最接近相应house_number的电台。

This question is very similar,但我不确定它们是否适用于经度和纬度,而且我不知道在处理经度和纬度时如何计算距离(这就是为什么我更喜欢简单地使用distm包中的geosphere

我从未使用过外部函数。如果上述问题的答案可行,我该如何调整答案以使用distm函数而不是sqrt函数?

2 个答案:

答案 0 :(得分:1)

您的问题比简单的合并要复杂得多,outer不太适合此目的。为了尽可能全面,我们要计算房屋和车站的所有组合之间的距离,然后仅保留每个房屋最近的车站。我们需要两个软件包:

library(tidyverse)
library(geosphere)

首先,准备一下。 distm期望将坐标按先经度排序,然后按纬度排序(您却相反),因此,请解决此问题,更好地命名列,并在输入错误时更正错字:

houses <- data.frame(house_number = c(1:3),
                     lon_house = seq(1.4, 1.6, by = 0.1),
                     lat_house = seq(1.1, 1.3, by = 0.1)
                     )
stations <- data.frame(station_number = c(1:11),
                       lon_station = seq(2, 3, by = 0.1),
                       lat_station = seq(1, 2, by = 0.1)
                       )

我们将创建“嵌套”数据框,以便更轻松地将坐标保持在一起:

house_nest <- nest(houses, -house_number, .key = 'house_coords')
station_nest <- nest(stations, -station_number, .key = 'station_coords')

  house_number house_coords        
         <int> <list>              
1            1 <data.frame [1 × 2]>
2            2 <data.frame [1 × 2]>
3            3 <data.frame [1 × 2]>

   station_number station_coords      
            <int> <list>              
 1              1 <data.frame [1 × 2]>
 2              2 <data.frame [1 × 2]>
 3              3 <data.frame [1 × 2]>
 4              4 <data.frame [1 × 2]>
 5              5 <data.frame [1 × 2]>
 6              6 <data.frame [1 × 2]>
 7              7 <data.frame [1 × 2]>
 8              8 <data.frame [1 × 2]>
 9              9 <data.frame [1 × 2]>
10             10 <data.frame [1 × 2]>
11             11 <data.frame [1 × 2]>

使用dplyr::crossing合并两个数据帧中的每一行:

data.master <- crossing(house_nest, station_nest)

   house_number house_coords         station_number station_coords      
          <int> <list>                        <int> <list>              
 1            1 <data.frame [1 × 2]>              1 <data.frame [1 × 2]>
 2            1 <data.frame [1 × 2]>              2 <data.frame [1 × 2]>
 3            1 <data.frame [1 × 2]>              3 <data.frame [1 × 2]>
 4            1 <data.frame [1 × 2]>              4 <data.frame [1 × 2]>
 5            1 <data.frame [1 × 2]>              5 <data.frame [1 × 2]>
 6            1 <data.frame [1 × 2]>              6 <data.frame [1 × 2]>
 7            1 <data.frame [1 × 2]>              7 <data.frame [1 × 2]>
 8            1 <data.frame [1 × 2]>              8 <data.frame [1 × 2]>
 9            1 <data.frame [1 × 2]>              9 <data.frame [1 × 2]>
10            1 <data.frame [1 × 2]>             10 <data.frame [1 × 2]>
# ... with 23 more rows

现在所有这些都准备就绪,我们可以在每一行上使用distm来计算距离,并保持每所房屋的最短距离:

data.dist <- data.master %>% 
  mutate(dist = map2_dbl(house_coords, station_coords, distm)) %>% 
  group_by(house_number) %>% 
  filter(dist == min(dist))

  house_number house_coords         station_number station_coords         dist
         <int> <list>                        <int> <list>                <dbl>
1            1 <data.frame [1 × 2]>              1 <data.frame [1 × 2]> 67690.
2            2 <data.frame [1 × 2]>              1 <data.frame [1 × 2]> 59883.
3            3 <data.frame [1 × 2]>              1 <data.frame [1 × 2]> 55519.

答案 1 :(得分:1)

使用match_nrst_haversine中的hutilscpp

library(hutilscpp)
houses[, c("station_number", "dist") := match_nrst_haversine(lat_decimal,
                                                             lon_decimal,
                                                             addresses_lat = stations$lat_decimal,
                                                             addresses_lon = stations$lon_decimal,
                                                             Index = stations$station_numer,
                                                             close_enough = 0,
                                                             cartesian_R = 5)]

houses
#>    house_number lat_decimal lon_decimal station_number     dist
#> 1:            1         1.1         1.4              1 67.62617
#> 2:            2         1.2         1.5              1 59.87076
#> 3:            3         1.3         1.6              1 55.59026

如果您的数据很多(即要匹配超过一百万个点)以提高性能,则可能需要调整close_enoughcartesian_R

`cartesian_R`
     

从要进行地理编码的点开始的任何地址的最大半径。用于加速最小距离的检测。注意,作为   参数名称建议,距离以直角坐标表示,因此   数量可能很小。

`close_enough`    
     

以米为单位的距离,如果低于该距离,则认为发生了比赛。 (被认为是“足够近”的距离   匹配。)

     

例如,close_enough = 10表示十米内的第一个位置将被匹配,即使稍后会发生更接近的匹配。

     

可以以字符串形式提供以强调单位,例如close_enough =“ 0.25km”。仅允许km和m。