Nextflow：是否可以将队列通道转换为值通道？

Question

我有一个进程A，它将文件输出到通道outA中。我想将该文件用作3个下游进程B，C和D的输入。由于默认创建的通道outA是一个队列通道，所以我不能多次使用该文件（不同于值通道）。

当前，我使用into运算符来复制通道outA，如here所述（请参见下面的代码）。

我还知道您可以通过执行Channel.value(file('/path/to/file.txt'))从文件创建值通道。

我当前的代码：

// Upstream process creating a queue channel with one file
process A {
    output:
        file outA
    "echo 'Bonjour le monde !' > $outA"
}

// Queue channel triplication
outA.into {inB; inC; inD}

// Downstream processes all using the same file
process B {
    input:
        file inB
    "script of process B $inB"
}

process C {
    input:
        file inC
    "script of process C $inC"
}

process D {
    input:
        file inD
    "script of process D $inD"
}

我可以正常工作，但是我想知道是否可以将队列通道outA转换为值通道，以便可以将相同通道用作流程B，C的输入和D。

Answer 1

您可以使用first()运算符来执行此操作，例如：

inX = outA.first()

process B {
    input:
        file inX
    "script of process B $inX"
}

etc

还请注意，当一个流程没有输入（如流程A）时，其输出是隐式的值通道。