从glm glht函数中提取原始p值（代替Tukey调整的p值）

Question

我得到了下面的代码，并被要求提取原始的p值而不是Tukey调整后的值（因为稍后我们将使用Homes-Bonferroni进行多次比较调整），但是我不确定是什么用（我不熟悉R）替换“ Tukey” .....

        res=glht(x, linfct=mcp(Letter="Tukey")
        out=summary(res)
        out

Answer 1

我找到了答案。对于其他感兴趣的人... multcomp软件包中glht函数的“ Tukey”选项实际上并不使用Tukey校正，它只是设置所有成对比较。它不执行p值；为此，您需要summary.glht。要获取原始p值，请使用test = adjusted（“ none”）。

res=glht(x, linfct=mcp(Letter="Tukey")
   out=summary(res, test = adjusted("none"))
   out