我正在运行这样的模型:
model<-lme(Juice~1+Fruit ,random=list(Place=pdIdent(~1)), method="REML",
control=lmeControl(niterEM=150 ,msMaxIter=200), na.action=na.omit,
data=customData, keep.data=FALSE)
我想为每种水果提取果汁的调整平均值。
我在lsmean()
软件包上找到了一些涉及lmerTest
的解决方案,但它引发了错误说:
该模型不是线性混合效应模型
所以,这里有点无能为力。
对于可重现的示例(这是我的数据看起来如何):
Fruit=c(sort(rep(1:40,5)),sort(rep(1:40,5)))
Juice=c(rnorm(200, mean=15:25),rnorm(200, mean=13:23))
Place=c(rep("A",200), rep("B",200))
customData=data.frame(Fruit,Juice,Place)
提前致谢。
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由于@ eipi10已经声明lsmeans()不适用于lme4包生成的对象。 lsmeans库可能会给你你想要的东西:
library(lsmeans)
lsmeans(model, "Fruit")