Question

我已经测量了10分钟间隔内不同样品（系列）的N2O浓度。每天两次测量两次，共9天。 N2O分析仪每秒保存一次数据（浓度）！

我的数据现在看起来像这样：

                   DATE Series        V       A         TIME Concentration
1: 2017-10-18T00:00:00Z    O11 0.004022 0.02011 10:16:00.746     0.3512232
2: 2017-10-18T00:00:00Z    O11 0.004022 0.02011 10:16:01.382     0.3498687
3: 2017-10-18T00:00:00Z    O11 0.004022 0.02011 10:16:02.124     0.3482681
4: 2017-10-18T00:00:00Z    O11 0.004022 0.02011 10:16:03.216     0.3459306
5: 2017-10-18T00:00:00Z    O11 0.004022 0.02011 10:16:04.009     0.3459124
6: 2017-10-18T00:00:00Z    O11 0.004022 0.02011 10:16:04.326     0.3456660

我想使用R HMR软件包分析气体通量。为此，我需要从准确时间（TIME）数据点中按升序计算测量时间点。时间应该像这样（表取自https://cran.r-project.org/web/packages/HMR/HMR.pdf）

Series;V;A;Time;Concentration
k0a; 140.6250; 0.5625; 0; 13.98
k0a; 140.6250; 0.5625; 10; 14.65
k0a; 140.6250; 0.5625; 20; 15.15
k0a; 140.6250; 0.5625; 30; 15.85

我如何在每个锅的每个单独的10分钟测量期内计算这个？基本上，它应该列出递增的nr。我的机器测得的浓度为秒每一秒。

我的想法是按“系列”和“日期”分组并进行循环。受R: calculate time difference between specific events的启发像这样：

library(dplyr)
df.HMR %>% group_by(DATE, Series) %>% 
  mutate(time_diff = ????)

非常感谢您的帮助！

Answer 1

使用lag可以解决问题。

df.HMR=read.table(text="No DATE Series V A TIME Concentration 
              1: 2017-10-18T00:00:00Z O11 0.004022 0.02011 10:16:00.746 0.3512232 
              2: 2017-10-18T00:00:00Z O11 0.004022 0.02011 10:16:01.382 0.3498687 
              3: 2017-10-18T00:00:00Z O11 0.004022 0.02011 10:16:02.124 0.3482681 
              4: 2017-10-18T00:00:00Z O11 0.004022 0.02011 10:16:03.216 0.3459306 
              5: 2017-10-18T00:00:00Z O11 0.004022 0.02011 10:16:04.009 0.3459124 
              6: 2017-10-18T00:00:00Z O11 0.004022 0.02011 10:16:04.326 0.3456660",
                  header=T,stringsAsFactors=FALSE)

df.HMR %>% group_by(DATE, Series) %>% 
  mutate(dt=as.POSIXct(df.HMR$TIME,format="%H:%M:%S"), time_diff = dt-lag(dt))

R：计算单独样本的测量时间点

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